A diferença entre os dois pode ser vista abaixo (o post é de um experimento comparando farinha de milho e farinha usada no pão anadema ):
A farinha de milho é o ingrediente branco e mais fino à direita. A primeira diferença óbvia é que a textura será diferente entre os dois. A segunda é que ela teria usos diferentes. Ambos seriam eficazes no deslocamento de farinhas contendo glúten (como em, nem seria útil na formação de glúten).
Em termos de substituição, no entanto, a farinha de milho é mais provável substituída por algo como farinha de semolina e farinha de milho é mais provável substituída por farinha de quinoa ou grão de bico.