Esse run-off que você está vendo provavelmente não é água, mas sim separação de gordura. Tocar ou provar um pouco do líquido; se parece oleoso, então é gordo.
Ao fazer bolonhesa, se você não quer que isso aconteça, você precisa freqüentemente tirar a gordura que sobe até o topo. Se você apenas mexer de novo, ele se separará novamente mais tarde.
Você também deve cozinhá-lo lentamente (skimming frequentemente) por umas boas 4 horas ou mais.
Eu devo notar que a gordura não é necessariamente má e alguns cozinheiros insistem que você nunca deve roçar, porque é onde o sabor está. Pessoalmente, eu nunca encontrei muita diferença no sabor, quer você pule ou não - mas se você não der uma olhada, o conteúdo de gordura faz com que a mistura se separe depois.
O mesmo acontece com o chili, ou qualquer prato onde você esteja usando o chuck que já não teve toda a gordura removida pelo escurecimento profundo. Eventualmente, durante o cozimento, essa gordura deixará a carne, e você deverá limpá-la, cozinhá-la ou lidar com a oleosidade.