Não que eu possa imaginar. Muitas das receitas que uso chamam para fazer massas em um processador de alimentos e o primeiro passo é muitas vezes "peneirar" a farinha, pulsando-a algumas vezes, sozinho ou com os agentes de fermentação.
Isso não deve prejudicar sua farinha, especialmente se sua receita pedir peneirar sua farinha.
Eu faço recomendo que você considere medir sua farinha em peso (se puder), se os pedaços forem grandes demais para dar uma boa medição volumétrica antes do processamento, especialmente se você estiver fazendo uma receita que geralmente é "exigente" em relação a quantidades de farinha ou que exige especificamente medições de volume "pré-peneiradas". O processamento da farinha provavelmente vai arejar um pouco e pode deixar suas medidas volumétricas de lado um pouco. As medições de peso não devem ser efetuadas por isso.
Se os pedaços forem pequenos (1/2 polegada / 1 cm), você poderá obter uma boa medição de volume antes de processar a farinha.
Considere voltar e nos informar como é isso!