Parece que você esqueceu (ou não foi direcionado) para assar cegamente a crosta. O cozimento cego é assar uma massa sem um recheio, de modo que fique na dianteira, vedando-a e evitando que fique encharcada.
Para assar cegamente, coloque a massa no prato como de costume, salpique a base com um garfo em alguns lugares, corte um quadrado de papel de forno aproximadamente do mesmo tamanho que o prato, coloque-o na massa e adicione alguns pesos de cozimento (pequenas bolas de cerâmica) ou feijão seco. Isso impede que a massa borbulhe.
Coloque em um forno pré-aquecido por cerca de 20 minutos até que a massa esteja levemente dourada. Retire do forno, remova os pesos e papel (se estiver usando feijão, você pode usá-los novamente, mas não os cozinhe para comer!) E deixe a crosta esfriar por 30 minutos antes de adicionar o recheio e completar o processo de cozimento.