Por "fica mais tempo", você quer dizer que o ovo permanece bom por mais tempo ou a bolsa de membrana / ar permanece por mais tempo?
Eu não sei porque você se importaria com a bolsa de ar, então eu vou com a outra.
A orientação não afeta visivelmente a qualidade do ovo. Eu não uso caixas de ovos. Eu guardo meus ovos em banheiras de plástico (com cuidado). Os ovos acabam em uma orientação aleatória e não há diferença perceptível entre quaisquer dois ovos.
Eu ouvi as pessoas armazenando os ovos de maneira diferente para centralizar as gemas em preparação para ferver. Isso é puramente uma coisa cosmética.