A massa de pão experimenta a "fonte do forno". Ou seja, a água na massa se transforma em vapor e dá um impulso extra rápido quando a massa é colocada em um forno quente.
Para a maioria dos pães a primavera do forno é uma coisa muito boa. Para pães grossos e planos, como focaccia e pizza, isso não é bom. A primavera, ou qualquer outra elevação, fará com que a massa não seja mais um pão achatado.
Colocar os amassados em pães planos é simplesmente para ajudar a mantê-los planos quando eles assam. Ao contrário da massa de pastelaria, onde a ancoragem perfura a massa e permite que o vapor escape, a ancoragem na massa de pão não deve cortar as camadas, mas simplesmente deixar recortes.
A pizza nem sempre precisa ser encaixada porque o peso das coberturas é suficiente para mantê-la plana. Eu não coloco minha massa de pizza.
Os recortes também são bons porque aumentam a área de superfície para tostar e segurar coberturas, como o azeite na focaccia, mas não acredito que esse seja seu objetivo principal.