É provável que você esteja disposto a modificar sua receita. Com um molho grosso de roux, não tenho certeza de como isso seria traduzido para o microondas (embora você seja bem-vindo a tentar, seguindo a resposta de Stephie)
Por outro lado, você provavelmente pode procurar por outros espessantes - a questão é que você precisa de um líquido espesso para derreter seu queijo, e quanto mais espesso ele for, menor a probabilidade de seu queijo se aglomerar em vez de derreter suavemente. . Você poderia tentar usar o amido de milho, que pode funcionar melhor (o sabor da farinha é mais óbvio quando não é cozido o suficiente, o amido de milho é mais sutil).
Ou você pode experimentar outros espessantes - Eu usei um pó de molho de queijo de água quente, apenas uma colher para engrossar que não adiciona muito sabor, já que é suave o suficiente para ser coberto com queijo e outras aromas no molho. Ou qualquer outro pó de molho de água quente que não vai competir em sabor muito, talvez um toque de pó de ouro, ou molho instantâneo, ou algo assim - apenas um pouco para engrossar o leite, mas o sabor adicionado é leve ao longo o volume da receita inteira. Eu usei pó de mostarda, ou pó de gema de ovo, que engrossam um pouco mais em pó - minha versão geralmente usa mostarda líquida e gema de ovo que ajudam a engrossar e emulsionar mesmo molhado, mas enquanto o pó de gema faz pouca diferença espessamento, mas mostarda em pó é geralmente muito mais picante e menos saboroso.
Às vezes eu vou misturar um ovo inteiro e mexer com frequência - o branco endurece e acaba agindo como um espessante, a gema dá sabor e ajuda a emulsionar, embora ajude que eu não me importe com o ovo ou com o fato isso pode ser um pouco mais pesado, o gosto é bom para mim. Ou eu poderia começar a derreter o queijo com a mostarda e o ketchup (que eu uso em vez do molho Worcestershire, com sabor similar, mas eu prefiro), e só adicione a gema depois, e leite um pouco de cada vez. e misturado. Para queijos muito afiados, ajuda deixá-los no leite por um tempo primeiro, hidrata-os um pouco mais e deixa-os derreterem melhor.