Você pode congelar o caramelo, mas não acho que seja sua melhor opção. Eu acho que sua melhor opção é derramar o caramelo enquanto ele ainda está quente o suficiente para despejar em discos de tamanhos iguais, e deixá-lo endurecer naturalmente. Use um silpat ou uma superfície levemente untada.
Fazer isso exigiria alguma prática, mas uma vez que você o tenha feito, você deve ser capaz de fazê-lo facilmente e com muito pouco desperdício.
Se você tiver a destreza, você pode até derramar o caramelo ligeiramente quente diretamente nos cookies.