Eu não misturo minha massa pré-ovo (não tenho certeza que roux é a palavra certa aqui), mas eu não tenho um mixer de stand. Deixá-lo sozinho funciona muito bem, desde que seja uniformemente arrefecido. Se você não misturar (ou mesmo se fizer) certifique-se de verificar a temperatura no meio da massa, não do lado de fora.
Como o SAJ14SAJ mencionou, a mistura exporá todas as partes ao ar de resfriamento, deixando-o esfriar mais rápido. Se isso é importante para você, não há nada errado em misturar. Pode alterar ligeiramente a textura na direção do produto final levemente mais mastigado devido à criação de algum glúten, mas a diferença não será muito pronunciada e pode não ser perceptível, pois a farinha é bem revestida em gordura.
Então, a conclusão: você não tem que misturar, mas você pode se quiser. Nenhum dano feito de qualquer maneira, e pode ir mais rápido com a mistura.