Seguro? Ou bom comer? Os pesticidas geralmente não penetram em produtos de pele grossa (laranjas, etc), então, desde que você não esteja usando a pele, não há muito com o que se preocupar.
Eles não são os melhores abóboras para usar por outros motivos (ligados nos comentários). Em resumo, o menor "açúcar" abóbora é melhor para cozinhar, se você tiver a opção.