Eu tive um problema semelhante uma vez, mas o vazamento era visível e a parte externa da privada estava molhada. A descarga do tanque produziu vazamento, mas a descarga com um balde não.
Parece que água de descarga limpa está de algum modo escapando da válvula de descarga para o vaso sanitário. Isto poderia ser de um encaixe do tanque desalinhado ou uma rachadura no material cerâmico. Presumo que você não tenha encontrado água escorrendo pelo lado de fora do aparelho.
Dependendo do design do vaso sanitário, a conexão entre o tanque e as partes do recipiente pode incluir um encaixe de metal na tigela. Isso pode ficar solto ou rachado e, assim, vazar água para fora do tubo de descarga, mas ainda dentro do vaso sanitário.
Ou uma imperfeição ou rachadura na cerâmica pode permitir que a água limpa escape da passagem da borda ou da passagem da lavagem, bem, seja qual for o nome dela e o design dessas passagens varia muito. O ponto é, a água pode escapar do seu caminho e ainda não sair do banheiro onde você a veria.
EDIT: algumas fotos para mostrar o que quero dizer:
As chamadas vermelhas mostram onde um vazamento invisível pode ocorrer somente quando o tanque está descarregando e não quando a descarga é feita na caçamba.