Você pode certamente aplicar - no sentido de que as circunstâncias que você descreveu não exigem que o consulado português em Londres rejeite um pedido seu.
O manual de processamento de vistos do Schengen dá o seguinte exemplo:
However, an application may be accepted from a person legally present – but not residing - in the jurisdiction of the consulate where the application is submitted, if he can justify why the application could not be lodged at a consulate in his place of residence. It is for the consulate to appreciate whether the justification presented by the applicant is acceptable.
[...]
Example: A Chinese professor has travelled to London to teach at a university summer school. During her stay, her father, who lives in France, falls seriously ill and in order to travel to France the Chinese woman applies for a visa at the French consulate in London.
The French consulate in London should deal with the application because it would be excessive to require the person concerned to return to her country of residence to apply for the visa.
Você ainda terá que convencer os portugueses de que você deve receber um visto - em particular, que você pretende deixar o espaço Schengen após a sua visita proposta - e todas as outras coisas sendo iguais , estar prestes a perder seu direito de permanecer no Reino Unido tornará isso mais difícil para você.
Eles são obrigados a começar com a suspeita de que você é um possível migrante econômico, então você terá que apresentar boas evidências de que você gostaria de voltar para o Reino Unido e voltar para o Equador
Por outro lado, ter tido um visto Schengen anterior (e, presumivelmente, tê-lo usado de acordo com as regras) contará, em certa medida, a seu favor.
Quanto mais difícil é impossível quantificar. Você só pode tentar e ver se isso será suficiente. Esteja ciente de que você tem algumas suposições automáticas trabalhando contra você e tente abordar essas questões diretamente em seu aplicativo.
Você pode aplicar mesmo antes de seu visto atual expirar; o visto que você solicita não pode ser válido concomitantemente com outro visto Schengen.