A maioria dos crimes no CSI é organizada ao final de um único episódio. Eles também têm arcos de história mais longos que levam de dois ou três episódios a uma temporada inteira para serem resolvidos. Os arcos da história Blue Paint Killer, Miniature Killer, Dick e Jane Killer e Dr. Jekyll são exemplos de casos que levam vários episódios para a equipe da CSI resolver. O episódio piloto da série também apresenta um caso que não foi resolvido até a segunda temporada.
Muito raramente, há casos que simplesmente não são resolvidos. Um exemplo é Sqweegel , que é baseado em um personagem da série de Anthony Zuiker, do criador de CSI Level 26 romances. Sqweegel foi responsável por uma série de ataques em um episódio na 11ª temporada, mas até agora não apareceu novamente.