Eu fiz isso na casa do lago da minha família, mas só pretendia que fosse assim por alguns meses até o tempo mais quente. Nós enquadramos dentro da janela, isolamos, e aplicamos barreira de vapor no interior como é padrão aqui. Não houve problemas no momento em que removemos a janela e consertamos o revestimento no final daquele ano.
Se você tem problemas de molde vai depender da qualidade e condição da janela. Alguma umidade vai ficar atrás da janela devido ao movimento do ar, mas não deve ser um problema a menos que a umidade pesada fique presa.