Não, não há provas concretas de que as Máquinas na Matriz funcionem como os computadores modernos no mundo real.
No entanto, se você quiser fazer perguntas sobre qualquer coisa no filme que não seja explicitamente e completamente descrita no diálogo apresentado dentro dos filmes (que é o que todos essas outras perguntas que você faz referência) E você deseja obter algum tipo de resposta significativa - não apenas 1.000 aleatórias "Acho que isso soa legal" - então precisamos começar a fazer algumas suposições sobre como as coisas trabalhos. Precisamos construir um ponto de referência comum para deduzir informações que não sejam especificamente descritas em fontes canônicas.
O meio mais fácil e mais comum de se fazer isso, em qualquer filme, é assumir que coisas que vagamente se assemelham ao mundo real funcionam de maneira análoga ao mundo real. Isso não significa que eles são literalmente idênticos, apenas que você pode fazer comparações entre o real e o equivalente fictício.
Para ter uma conversa significativa sobre como as bolas de fogo mágicas funcionam no Senhor dos Anéis, precisamos fazer algumas suposições sobre como funciona o fogo mágico. É útil supor que o fogo mágico funciona basicamente da mesma forma como fogo real, além de sua criação mágica, para que possamos tirar conclusões sobre suas limitações e produção de energia. Tecnicamente, a magia é uma força que rotineiramente desafia as leis da física, mas se não fizermos algumas suposições sobre o fogo mágico, então não poderemos realmente começar uma conversa dessas.
Da mesma forma, é útil supor que as Máquinas e seu mundo de realidade virtual sejam análogas a computadores reais e ambientes simulados em computador do mundo real (embora com MUITO mais avançada geração de procedimentos e recursos gráficos.) Não estamos dizendo que as Máquinas literalmente rodando em uma variante distro linux, mas assumindo que suas habilidades de programação e de rede são de alguma forma semelhantes, nos dá um "terreno comum" para discutir "como a rede Machines". Desde que, é claro, nada nos filmes contradiga explicitamente essas suposições.