Você não pode fazer seu sistema de zona única se comportar como um sistema de 2 zonas apenas alterando o termostato, infelizmente. O que você está sugerindo seria mais ou menos equivalente a realocar o termostato no andar de cima. Para fazer isso, você pode mover o termostato e a fiação existentes ou obter um efeito semelhante obtendo um termostato com um sensor de temperatura remoto sem fio. No inverno, você faria com que o termostato baseie sua operação na temperatura baixa e, no verão, mova o sensor para o andar de cima.
Mas - isso apenas executaria o AC mais. Você ainda terá o problema de estar no andar de cima muito mais quente, mesmo se estiver no andar de cima e no andar de baixo. Você provavelmente poderia obter um efeito similar simplesmente diminuindo a temperatura do seu termostato sem movê-lo.
Você mencionou que sua casa foi construída em 1941. Uma causa comum de desaquecimento no andar de cima de casas antigas é a falta de um duto de retorno no andar de cima. Isso não deixa escapar o ar quente que se acumulou no andar de cima; o ar frio bombeado ali vai se estabilizar primeiro. Se você tiver um retorno no andar de cima, tente fechar seu retorno no andar de baixo no verão, para que seu sistema seja forçado a puxar mais do andar de cima. Se você não tiver um retorno para o andar de cima, tente fechar algumas de suas aberturas no andar de baixo, para que mais do seu ar frio suba. Sim, isso fará com que seu soprador funcione um pouco mais, mas não é incomum e deve estar bem.
Finalmente, uma opção de baixa tecnologia, mas possivelmente útil, seria adicionar um ventilador de piso soprando ar no andar de cima. Corra por um dia ou mais e veja se faz diferença na equalização das temperaturas.