Voldemort claramente entende as regras de Wand Allegiance quando matou Snape especificamente para assumir o controle da Elder Wand, ele simplesmente não sabia que Draco Malfoy tinha desarmado Dumbledore antes que Snape o matasse.
Por que Snape não lhe disse isso, não podemos ter certeza, mas talvez ele não quisesse indiretamente matar Draco contando isso a Voldemort.