Não é possível dar uma resposta definitiva à pergunta geral. Sempre que duas partes discordam sobre algum fato, qualquer uma pode estar errada. Mas é possível dar algumas orientações gerais.
Em primeiro lugar, é mais provável que as informações mais recentes sejam corretas, o que deve ser óbvio. Em segundo lugar, porque o governo do país faz as regras, a informação do governo do país é mais provável que seja correta.
Neste caso, parece que o "novo portal" aberto pela França deve ser confiável em ambos os aspectos: é recente e é uma fonte oficial do governo.
O problema, é claro, é (como você descobriu) que o contratado terceirizado, neste caso, a VFS, pode se recusar a aceitar sua inscrição, mesmo se eles estiverem errados e você estiver certo. Você realmente não tem escolha a não ser cumprir suas exigências.
Neste caso, a conformidade não tornou a sua aplicação menos strong (e é difícil imaginar como uma situação semelhante poderia torná-la menos strong), por isso não é uma grande perda para você. Ainda assim, você pode registrar uma reclamação por meio dos canais oficiais. Idealmente, isso chamaria a atenção do governo francês para o fato de que o contratado está impondo exigências espúrias aos solicitantes de visto, e deve levar o governo a informar ao contratado sobre os requisitos corretos.
(Alguns podem dizer que porque o governo faz as regras, não é apenas "mais provável que seja correto", mas garantido para ser correto. Mas ainda é possível para os governos dar informações incorretas, por Por exemplo, devido a falta de comunicação, mal-entendidos ou páginas da Web inadequadamente mantidas.)