Eu não tenho certeza de como há alguma confusão sobre o Professor X estar na cadeira de rodas. Ele é claramente "baleado" (bala defletida) no filme Primeira Classe , além de estar na cadeira de rodas no final.
Quanto à história de Emma, havia muita confusão sobre o personagem graças ao filme Wolverine: Origins . Há uma jovem garota sendo mantida em cativeiro por Stryker, que pode se transformar em diamante. Muitos acreditavam que ela era Emma, mas ela só é referida como "irmã de Kayla", mesmo nos créditos. É possível que eles pudessem fazer essa referência em filmes futuros, ou não.
Com relação ao "relacionamento" da Sabertooth e do Wolverine, isso será um pouco mais fácil de fazer. Desde que Wolverine perdeu a memória, ele não tem idéia de por que a Sabertooth parece estar caçando ele. Nos quadrinhos, a Sabertooth o persegue todos os anos em seu aniversário, apenas para vencê-lo. Isso é para mostrar que ele sempre será o mutante superior. Se bem me lembro, até hoje, o Wolverine não derrotou a Sabertooth de uma em uma.
Agora, quanto a possíveis problemas que podem surgir, há um que vem à minha mente. Se Wolverine faz uma aparição neste filme, muito mais do que a aparição que vimos na Primeira Classe, por que o Professor X aparentemente não tem conhecimento dele em X-Men? A falta de memória do Wolverine é compreensível, já que sabemos que Wolverine: Origins acontece algum tempo antes da Primeira Classe , e assim ele perdeu a memória.
Em última análise, porém, a triste resposta é que eles vão "tentar" abordar o que eles acham que precisa ser abordado e nada mais. A esperança é que, se houver algum buraco gritante, eles consertarão isso. Mas cabe ao diretor e aos redatores prestarem atenção e tentar fazer com que ela se encaixe o mais perfeitamente possível.