Eu ouço Popayan e Pasto são bastante seguros para viajar agora. Você não deveria ter nenhum problema. Você pode tomar precauções extras pegando empresas de ônibus que viajam diretamente para os terminais e viajando apenas durante o dia.
Você também pode ler posts no fórum, eles são bastante úteis.
I did the Pasto to Popayan route 2 weeks ago, then went on to Tierradentro from Popayan. Everything was quite safe, and there were many many foreign tourists enjoying the beautiful streets in Popayan. (Source)