Em todos os livros e jogos, nunca vi um veículo aquático usado para aplicação militar. Dada a eficiência dos veículos aéreos no jogo, é provável que os navios e barcos sejam muito limitados na aplicação.
Basta olhar para o dropship Pelican e Chantant's Phantom do UNSC para ver os usos variados que ele tem. Ambos parecem ter alcance significativo, alta velocidade (centenas de quilômetros por hora) e são capazes de viajar no espaço suborbital. Dado que mesmo um navio veloz ficaria confinado a uma pequena massa de água, não podendo viajar mais do que algumas centenas de quilômetros por dia, os navios provavelmente se tornariam obsoletos anos antes dos eventos da guerra de convênios humanos.
Eu me lembro vagamente de um pequeno esquife sendo usado em um dos livros do Kilo-Five, mas isso foi para uma viagem de pesca, creio eu, não para aplicações militares. Não me lembro de nada sobre a embarcação Forerunner maior do que pequenos esquifes, se é que existia.
Editar : Graças à resposta de PhilPursglove, o pequeno skiff é realmente o Sanghelli Ocean Skimmer , que não é estritamente uma embarcação em que realmente paira sobre a água. Há dois 'barcos' humanos listados que ele encontrou, e um é um barco real, mas o outro é o Barco de assalto armado . A única menção disso vem de Halo: O Dilúvio , e não parece ser muito de um embarcação :
Most combat landings were made via armed assault boats, but the boats were slow, and subject to antiaircraft fire. That was why the UNSC had invested the time and money necessary to create a second way to deliver troops through an atmosphere: the HEV, or Human Entry Vehicle.
Então são algumas embarcações, elas são extremamente raras.