Sim, você pode.
Anedótica, a mãe faz lotes de pequenas spanakopita com antecedência e congela-los para uso posterior.
O enchimento deve estar frio quando você está montando o spanakopita.
(edit) Você precisa assá-los antes de congelá-los.
Gostaria de armazená-los na geladeira em um recipiente de plástico em uma única camada. Se congelar, coloque-os em uma assadeira e congele-os em porções individuais, coloque-os em uma bolsa congeladora.