O Fantasma não é afetado pelo feitiço Confusão . Enquanto não há uma declaração strong de que todas as criaturas afetadas por um feitiço são "alvos" do feitiço, eu encontrei isto na página 205 do PHB:
Many spells specify that a target can make a saving throw to avoid some or all of a spell's effects. The spell specifies the ability that the target use for the save and what happens on a success or failure.
Isso parece implicar que os alvos de um feitiço são quaisquer criaturas afetadas por ele, embora obviamente não seja tão claro quanto poderíamos esperar. Outro exemplo, na página 196:
If a spell or other effect deals damage to more than one target at the same time, roll the damage once for all of them. For example, when a wizard casts fireball or a cleric casts flame strike, the spell's damage is rolled once for all creatures caught in the blast.
Como backup para isso, temos a habilidade Posse do Ghost na página 147 do Livro dos Monstros:
The ghost can't be targeted by any attack, spell, or other effect, except ones that turn undead[...].
O Turn Undead é uma habilidade AOE, não é um alvo. Se o Fantasma ainda fosse destinado a ser afetado por magias e habilidades AOE, a advertência para o Turn Undead não seria necessária.
E finalmente, se as magias AOE fizeram afetar um Ghost no meio de possuir alguém, o Ghost seria afetado por todas Fireball ou Lightning Bolt que atingiu a criatura possuída. Em seu quarto ponto, você afirmou que isso obviamente não era o caso, com o qual eu concordo. Não há razão para que o Confusion funcione de maneira diferente de qualquer outro feitiço de AOE.