O maior problema será a diferença de altura da madeira para laminar e uma moldagem para cobrir a transição. Dependendo da altura da madeira, você está olhando pelo menos uma diferença de meia polegada (no mínimo) entre a madeira e o laminado. E a moldagem também pode ser um risco de tropeço para qualquer pessoa mais velha ao entrar / sair de sua casa.
Minha escolha pessoal seria remover a seção de madeira para remover os dois problemas acima.