Existem diferentes tipos de códigos atribuídos aos aeroportos. Códigos IATA , que são os códigos de três letras que você menciona; são para propósitos de identificação de indústria de viagem (a propósito, estes não são restringidos a aeroportos - estações de trem também têm estes códigos). Estes são utilizados por companhias aéreas e agentes de viagens.
Os outros códigos de quatro letras são os códigos ICAO . Estes são usados para navegação, tráfego aéreo e planejamento de vôo.
Os códigos ICAO têm um padrão definido, cada região recebe uma letra e todos os códigos começam com essa letra. O Canadá recebe um C prático, e o US é K :
No entanto, os códigos IATA são arbitrários. Por alguma razão, o Canadá recebeu o 'Y' e, portanto, todos os códigos IATA no Canadá começam com Y.
Há YYC (Calgary), YVR (Vancouver), mas então você tem YQX (Gander) e YXS (Prince George) e YUL (Montreal-Trudeu).