Nenhum lote parece que a cor pareceria preocupante para o soro do queijo de fazendeiro. Se não houver outros fatores preocupantes (como um cheiro estranho ou manuseio inseguro), provavelmente presumiria que o soro de leite e o queijo são seguros para consumo - embora sua tolerância ao risco possa variar.
Por que os lotes parecem diferentes - parece que um lote ainda contém algumas proteínas lácteas emulsionadas nele. Eu vi soro de leite muito leitoso (acontece quando a coalhada não se ajustou bem), então, novamente, por si só, isso não me faria hesitar. Percebo que esse lote também parece maior - o que pode significar que seus lotes foram desigualmente divididos, mas também pode indicar que você retirou um pouco menos das proteínas do leite desse lote, sobrou mais para colorir o soro do leite e talvez tenha menos coalhada fora desse lote.
Por que os lotes saíram de maneira diferente, só posso especular. Pode ser que um lote tenha um pouco mais de tempo para curar do que o outro (enquanto você estava processando o outro lote, talvez), então os coalhos com um pouco mais de tempo separaram do soro um pouco mais limpo. Pode ser que as proteínas lácteas estivessem pairando mais no topo, ou então se acomodando no fundo da mistura de coalhada e soro de leite, e assim, quando você as colocava nos dois filtros, um era mais claro e toda a coloração leitosa extra. Pode ser que um coador tenha um filtro melhor para pegar as proteínas leitosas, ou um coador pressionado com mais força e torcido mais o soro do leite - incluindo aquelas proteínas extras.
Se eu estiver certo, então o soro à direita (mais branco e mais volumoso) deve poder ser coalhado novamente em algum tipo de queijo de soro de leite, para tirar o resto das proteínas lácteas, enquanto à esquerda produziria muito menos (se houver) se for re-coagulado.
Novamente, você deve ser cauteloso, e descartar se há cheiros, sabores ou texturas, ou se você tem motivos para acreditar que o leite, queijo ou soro de leite foi manipulado de forma insegura. Mas se a única diferença é a cor e a proporção de proteínas do leite que sobram, então ambos os lotes devem ser seguros para uso.