1100 Watt significa 1100 Joules por segundo (energia ao longo do tempo). 1100 Watt durante um período de 240 segundos, portanto, é 264000 Joules. Para entregar 264000 Joules de energia com apenas 800 Watt leva 330 segundos (5,5 minutos), como você esperava.
Como KatieK notou, há algumas preocupações adicionais. Uma boa receita lhe dirá para deixar o produto cozido ficar por um tempo. Isso permite a difusão de calor, então todos os Joules de calor serão bem distribuídos. Mas se você cozinhar a uma potência menor, o calor já estará mais difuso. Ou seja com menor potência, você não precisa descansar o produto por muito tempo.
Outra diferença pode ser que você não está apenas aquecendo o produto, mas você está confiando em um efeito secundário, como matar germes. Para isso, você precisará ter todo o produto acima de uma temperatura crítica por um certo tempo. Isso geralmente significa que você não precisa ajustar os horários tanto quanto você esperaria pela fórmula simples.
Por outro lado, um produto quente perderá calor ao meio ambiente ao longo do tempo. Ou seja nem todos esses 264000 Joules permanecerão no produto que você está aquecendo. E com mais tempo gasto em temperaturas médias, há mais perda de calor em um microondas de baixa potência.