Como o Atlantis chegou a ser encoberto quando foi originalmente submerso quando o time chegou na cidade? [fechadas]

Como você diz, em Stargate Atlantis 1ª Temporada, Episódio 1 ( Nascente ) a cidade-nave de A Atlântida é submersa e protegida por um escudo que retém a água.

No entanto, em Stargate Atlantis Season 2 , Episódio 1 ( The Seige, Parte III ) o escudo é modificado por Rodney McKay (e Radek Zalenka) para que ele também possa ser usado como um manto, como um Puddle Jumper (no entanto, Atlantis é incapaz de ter ambos escudo e manto ativos simultaneamente)

SHEPPARD: We disappear.

CALDWELL: Destroy the city, you mean?

SHEPPARD: No, we just make it look like we did.

WEIR: How?

(Rodney clicks his fingers.)

McKAY: We cloak it.

ZELENKA: Yes. Yes! The Puddle Jumpers are equipped with cloaking technology which renders them invisible to the naked eye, and to Wraith scans. If we just simply remove one of the cloak generators from the Puddle Jumper ...

McKAY: I wouldn't say simply, but yes -- by interfacing a Jumper's stealth cloak generator with the city's shield, we should be able to render the city invisible.

^{(Transcript on Gateworld)}

(ênfase minha)

This is part of a plan to use a nuclear warhead to trick the Wraith into thinking that Atlantis has self-destructed

É também neste mesmo episódio que o Daedalus entrega o ZPM ao Atlantis, o que significa que ocorre antes do Stargate SG-1 Season 9 Episode 13 ( Efeito de ondulação )

(Kudos a Lightness Races in Orbit para rastrear a cotação)

A equipe nunca teve que "procurá-lo" ou "encontrá-lo", embaixo d'água ou não. Eles "encontraram" porque tinham o endereço do portão e o marcaram no portão da Terra na Antártida. Eles não sabiam que estava submerso até que chegaram lá e tentaram olhar pela janela. O sistema de portões sabia como conectar o buraco de minhoca ao portão de Atlântida, embora a cidade estivesse submersa na época.

O ZPM está sendo usado para manter a cidade embaixo d'água, o que é porque o Wraith não pode detectá-lo. Essa é a natureza do "manto". Quando os humanos chegam, a cidade se energiza, esgotando ainda mais o ZPM, por isso não pode manter o escudo faminto por poder segurando a água. Não tem escolha a não ser a superfície, o que a deixa vulnerável aos Wraith.

Esta é a conversa à qual você está se referindo:

BLACK BDU MITCHELL: All that ZPM is doing right now is allowing one-way travel from the Pegasus Galaxy to Earth. The billions of the lives that we save is worth more the inconvenience of schlepping back and forth on the Daedalus.

MITCHELL: We need that ZPM to cloak Atlantis. If the Wraith come back and discover the city wasn't destroyed, they'll launch another attack. If Atlantis falls, this galaxy is the next target.

^{(Transcript on Gateworld)}

Se esta SG-1 conversa tivesse ocorrido antes de Atlantis o show ter começado, quando a cidade estava no fundo do oceano, Cam não saberia que a cidade existia e muito menos que estava sendo encoberto por um ZPM (que, como você apontou, não era).

Na verdade, essa conversa ocorre pelo menos um ano após a expedição da Atlântida já ter chegado (por Gate, que funciona independentemente), durante a segunda temporada de Atlantis , em que ponto a expedição estava usando o MoWeb ZPM para encobrir periodicamente a cidade usando um ZPM após os eventos de "The Siege" :

SHEPPARD: Well, what if they thought we were gone?

TEYLA: Then there'd be no reason for them to stay.

SHEPPARD: Exactly!

McKAY: Exactly what?

SHEPPARD: We disappear.

CALDWELL: Destroy the city, you mean?

SHEPPARD: No, we just make it look like we did.

WEIR: How?

(Rodney clicks his fingers.)

McKAY: We cloak it.

ZELENKA: Yes. Yes! The Puddle Jumpers are equipped with cloaking technology which renders them invisible to the naked eye, and to Wraith scans. If we just simply remove one of the cloak generators from the Puddle Jumper ...

McKAY: I wouldn't say simply, but yes -- by interfacing a Jumper's stealth cloak generator with the city's shield, we should be able to render the city invisible.

CALDWELL: That's all well and good, but I think if the city were to suddenly disappear, they might be able to put one and one together.

McKAY: Which is why we fake a self-destruct. Have the Daedalus beam a nuke right above the city's shield, and then detonate it. While their sensors are blinded, we cloak the city; when the smoke clears ...

WEIR: ... nothing but ocean.

[..]

McKAY: I can confirm that. They're headed for hyperspace. Look, I'm gonna keep the cloak up for a while just to be sure, but, uh, I think they bought it.

^{(Transcript on Gateworld)}

Estes eventos são narrados nas primeiras temporadas do show Atlantis . O wikia do Stargate tem uma cronologia de como os episódios se entrelaçam entre os dois shows (que geralmente seguiam a ordem aérea; lembre-se, SG1 e SGA transmitido simultaneamente por vários anos).

Na verdade, no episódio de Atlantis ( "Critical Mass" ) que foi ao ar diretamente após "Efeito Ripple" :

WEIR: How long before they get here?

McKAY: A day, maybe a day and a half, depending on if they need to make a hyperspace pause along the way. We'll need to cloak the city again.

^{(Transcript on Gateworld)}

Um lembrete muito oportuno do que Mitchell estava se referindo.

Se você realmente quiser um furo de trama daquele episódio, tente isso !

Se eu estou entendendo bem a confusão, você errou que o Stargate SG-1 e o Stargate: Atlantis se sobreponham cronologicamente. A Atlantis é descoberta em algum lugar perto do final da 7ª temporada da SG-1 e eles funcionaram em paralelo por alguns anos depois disso.