Além dos pontos que a HorusKol fez, há algumas coisas que foram mostradas para bloquear consistentemente transportadores em Star Trek. Um dos maiores é o depósito de alguns minérios. Outro é o technobabble (que é frequentemente explicado por coisas naturais, como depósitos de minério ou condições atmosféricas). A última é grandes quantidades de terra ou pedra.
O ponto final é inconsistente - Wrath of Khan apresentou vários transportes para um sistema de cavernas que estavam abaixo da superfície, por exemplo. Dito isto, a estação espacial em que eles se encontravam o fazia regularmente como parte de um estudo científico de longo prazo, o que indica que eles podem ter feito algo para possibilitá-lo - coordenadas extremamente específicas ou intensificadores de padrões ou algo semelhante.
Por isso, diria que as condições em que os metais e minérios que não podem ser facilmente replicados existem provavelmente seriam condições que impedem o uso do transportador.