Desconhecido.
Até onde eu sei, não há nenhuma declaração canônica nos dizendo em qual casa ele estava.
Há especulações de que suas tendências de Comensal da Morte / geral não-bondade fizeram dele um sonserino, mas até mesmo o notoriamente duvidoso HP Wiki acolhe isso como especulação :
Barty appeared to have been highly cunning and diabolically intelligent (he was most likely in Slytherin while at Hogwarts).
Eu acho isso um pouco duvidoso. Dado o quanto Crouch Sênior é honesto, acho que ele pode ficar um pouco surpreso se seu filho for escolhido para a Sonserina, e prestar mais atenção a ele. Apenas um pensamento.
Se você confia no testemunho de Crouch Sr. (ele estava entusiasmado neste ponto), então Crouch Jr. era um superastro acadêmico:
“Yes, my son has recently gained twelve O.W.L.s, most satisfactory, yes, thank you, yes, very proud indeed.”
— Goblet of Fire, chapter 28 (The Madness of Mr. Crouch)
Isso pode sugerir uma classificação da Corvinal. (Em contraste, Hermione alcançou apenas dez O.W.L.s.)