A única vez que ouvi conselhos sobre a orientação do piso em relação às janelas é que você quer que as junções do piso estejam na mesma direção da direção predominante da luz solar. Isso é para que a luz do sol brilhe ao longo das rachaduras em vez de cruzar com elas. É sobre fazer com que as sombras desapareçam para que a aparência geral pareça mais limpa.
Com isso dito, a menos que você esteja confiante no método de instalação fornecendo força suficiente, você deve instalar o piso ortogonal às vigas do piso, independentemente da orientação da janela.