Kaio-ken é claramente inferior ao seu Super Saiyan . Uma vez que Goku é capaz de sustentar suas habilidades Super Saiyajin, ele pára mesmo usando Kaio-ken depois de um tempo. Ele foi incapaz de assumir os poderes do Super Saiyajin quando ele voltou à vida para combater Freiza, então ele usou as habilidades de extensão de poder do Kaio-Ken, que aumentaram seu poder por múltiplos. Goku era o único praticante conhecido da técnica Kaio-Ken.
O Kaio-ken não foi uma extensão natural dos poderes Saiyajin, foi ensinado a Goku pelo Rei Kai, que inventou o poder mas não foi capaz de usá-lo. A maior fraqueza do Kaio-Ken foi a terrível tensão que colocou no corpo de Goku. Após o seu uso, Goku estava completamente esgotado de energia e incapaz de utilizar quaisquer habilidades físicas por algum tempo.When Goku first mastered the Kaio-ken, the furthest he could handle was the Kaio-ken x4, but through training at 100x gravity and then later with his dramatic strength increase after his fight with Captain Ginyu, he was able to withstand astounding multiplications of the Kaio-ken technique, such as Kaio-ken x10. The highest multiplication for the Kaio-ken ever seen was the Kaio-ken x20, which Goku used against Frieza. --Dragonball Wiki
O estado Super Saiyajin é uma extensão mais natural das espécies Saiyajin e, uma vez dominado, pode ser mantido de forma muito mais eficaz e sem os efeitos colaterais do Kaio-Ken. No entanto, requer um Saiyajin para alcançar um estado significativamente mais alto de domínio de batalha e, assim, ficou invisível por algum tempo entre os Saiyajins.
Dado um confronto entre um Saiyajin com Kaioken e um Saiyajin sem ele, o Kaioken, especialmente se o praticante for experiente, é superior. No entanto, um confronto entre o Kaio-Ken e o Super Saiyajin quase sempre deixaria o usuário Kaio-Ken derrotado. Super Saiyajin nível 1 é muito superior ao Kaio-Ken, mesmo nos 20 níveis.
In Dragon Ball Z: The Return of Cooler, Goku again uses the Kaio-ken on Meta Cooler, but it again proves far too feeble, forcing Goku to go Super Saiyan soon after. --Dragonball Wiki
Foi demonstrado (uma vez) que o Kaio-ken poderia ser empilhado em cima dos poderes do Super Saiyajin, mas a pressão sobre Goku era tão grande que acreditava-se que ele poderia matá-lo. Ele usou esse arranjo de poder em uma batalha contra o Pikkon .