A pedra estava dentro do espelho; o espelho era uma camada adicional de proteção para a Pedra.
O espelho era de fato a parte única das defesas que representava qualquer problema real para Quirrel; isso é evidente pelo que vemos no livro:
"Now, wait quietly, Potter. I need to examine this interesting mirror."
It was only then that Harry realized what was standing behind Quirrell. It was the Mirror of Erised.
"This mirror is the key to finding the Stone," Quirrell murmured, tapping his way around the frame. "Trust Dumbledore to come up with something like this... but he's in London... I'll be far away by the time he gets back...."
Harry Potter and the Sorcerer's/Philosopher's Stone, chapter 17: "The Man With Two Faces"
O Espelho de Erised é em si a defesa final da Pedra. A Pedra estava escondida dentro do espelho de tal maneira que apenas alguém que não quisesse realmente usar a Pedra poderia obtê-la; foi movido para onde a Pedra estava, porque estava ajudando a guardar a pedra.