Sim, você precisa liberar a imigração e a alfândega em Atlanta.
Mas na área de imigração de Atlanta, a área de imigração é bastante grande e bem administrada, então o tempo de processamento não é tão ruim. Enquanto eu, cidadão norte-americano, percorro uma linha diferente, já vi estrangeiros de meus vôos aguardando sua bagagem na mesma hora que eu, então obviamente conseguiram passar pela linha de processamento em tempo decente.
Assumindo que você está em um bilhete, suas malas são despachadas, assim que você desalfandega a alfândega, você deixa suas malas revendo o lado de fora da alfândega e desimpede a segurança e segue para o seu próximo portão. Razoavelmente para a frente.
Se você estiver atrasado com a imigração e perder seu voo de conexão, a companhia aérea tentará colocá-lo no próximo voo disponível.