A cor nas batatas é atribuída à oxidação que é um processo natural de degradação. A principal causa é a exposição direta com o ar livre, mas outros fatores podem acelerá-lo (até mesmo o metal na faca ou as lâminas do processador de alimentos no seu caso). Alguns vegetais são mais suscetíveis que outros (por exemplo, os abacates ficam pretos em questão de minutos). Existem alguns métodos para retardar essa transformação como um banho em água misturado com algum ácido (limão, vinagre ...) ou bicarbonato de sódio.
Agora a boa notícia: o resultado da oxidação não é tóxico, o pior é que quanto mais o processo continua, mais vitaminas a comida perde. No seu caso particular, acho que o desidratador de alimentos contribuiu para a oxidação.
Desde então eles estão desidratados você poderia regenerá-los com um líquido e então você pode tentar cozinhá-los (talvez alguns purê), mas você não vai receber de volta a cor clara agradável, eles vão continuar procurando ... ruim.