Além de algumas declarações vagas de que "foi idéia de Brando", não consigo encontrar nenhuma informação detalhada sobre por que ele queria fazer isso. No entanto, algumas informações que encontrei podem fornecer uma sugestão.
The designation of the stylized 'S' as Jor-El's family crest on the planet Krypton solved an apparent logical dilemma for the creators of the Superman films. The 'S' is indestructible, as is the rest of Superman's uniform, but Kal-El was not called "Superman" on Krypton. The creators decided to adorn every Kryptonian leader's robes with a family crest (as noted in publicity magazines at the time) and the one for Jor-El's family happened to look like a stylized 'S'.
Some reports say it was Marlon Brando's own idea for Jor-El to wear the recognizable 'S' symbol in the scenes on Krypton. The establishment of the 'S' emblem as the El family crest was a departure from the first three eras (Golden, Silver, Modern) of official DC Comics continuity, in which the 'S' emblem and costume were both created by Martha Kent (Mary Kent in the Golden Age) after Clark chose his heroic name. However, in the 2003 series Superman: Birthright, the 'S' symbol has been changed to represent a universal symbol of the planet Krypton, adorning their flags and military uniforms in holographic projections Clark finds contained in a device that came with him from Krypton. He chooses to wear the symbol to honor his Kryptonian heritage, and the name "Superman" is given to him by the newspapers.
E de IMDB Trivia para Superman, o filme
The Superman "S" logo that Marlon Brando wears on his white cloak looks the same as the one used for George Reeves costume in the TV show Adventures of Superman (1952). This was probably an homage. Since this film, the idea of the "S" symbol being a Kryptonian family crest of the House of El has been incorporated into Superman's comic books and subsequent adaptations.
Então o 'S' era simplesmente outro 'brasão de família' e talvez Brando sugerisse usar o que George Reeves usara como forma de prestar homenagem. Baseado no que li, não parece que tenha muito a ver com ele sendo altamente remunerado ou exercendo controle criativo. Parece que ele forneceu uma contribuição valiosa para os criadores e eles concordaram.
Adendo -
Um comentário foi adicionado afirmando que já estava bem estabelecido em cânone que Jor-El usava o mesmo símbolo de seu filho. As informações de suporte fornecidas mencionavam que ele "geralmente usava o símbolo do sol de Krypton". Agora essa é uma afirmação verdadeira, mas não entendo como isso é o mesmo que 'filho'. Se você conferir o Jor-El daquela época (na época do filme de Brando), verá que o símbolo em seu peito é distinto e na verdade parece um 'sol' (com um 'u') e nada como o estilizado 'S' usado por Brando no filme e pelo próprio Superman.
