Eu encontrei um link para estudantes internacionais que aborda essa questão :
If you are entering the United States, you may be stopped by the Customs and Border Protection Officer at the inspection booth if the officer sees an arrest or fingerprint record reported in the database. That officer may take you to a separate interview area. As with the visa application, it is essential that you have with you documents issued by the court that address the original charges, and the subsequent disposition of the case. A letter from the lawyer who assisted you, that explains the charges and the judgment is also helpful.
Tão longa história curta. Se você marcar esta caixa porque foi preso, deverá ter a documentação de que este era o caso de uma identidade equivocada ou que você foi liberado sem problemas criminais pendentes. De acordo com a página que eu relacionei acima, os serviços consulares podem (em alguns casos) realizar verificações completas antes de considerar a concessão de um visto.