Do Steel Tube Institute (instituto composto por vários fabricantes de eletrodutos de aço):
Question: Can EMT be used on roof-tops?
Answer: There is no prohibition in the NEC. In some installations, there may be a concern about physical damage or corrosion protection. This is often a judgment call by the authority having jurisdiction. The NEC does not allow EMT to be used where, “during installation or afterward, it will be subject to severe physical damage.” The NEC also requires the EMT to be “securely fastened in place” and provides requirements for supports. The AHJ may determine more supports are necessary. If the AHJ approves the installation with EMT, consideration should be given to compliance with NEC 110.12, 300.6, 300.7(A) & (B), 358.10 and 358.30.
Portanto, se o seu eletroduto foi instalado com conexões projetadas para um "local úmido" (parece que são, mas confirmam) e está devidamente suportado, e as provisões para expansão foram fornecidas (se necessário), então você deve ESTÁ BEM. Mais importante ainda, se a Autoridade Jurisdicional (AHJ) aprovou a instalação, então você está bem.
No final, não faria mal aplicar silicone. Use 100% de silicone e limpe a (s) área (s) primeiro para que fiquem.