De sua descrição, a "coisa que falta" que saltou para mim foi sal .
Além disso, especiarias e ervas ajudam a dar um sabor melhor e mais familiar.
Eu fiz molho básico de tomate, pois é fácil de guardar e guardar - e assim que eu tiver a lata aberta, eu prefiro usá-la do que esperar que ela fique ruim enquanto eu abro um molho de tomate separado. O sal para mim é geralmente o catalisador que faz com que ele passe de pasta aquosa para temperado com molho, para mim - e demora um pouco até que o resultado pare de ficar aguado.
Normalmente, estou fazendo apenas um pouquinho de cada vez, talvez meia xícara ou mais (para tortilla pizzas ou similares). Eu costumo misturar em partes iguais pasta e água, adicionar meia colher de chá ou mais de sal e algumas ervas secas, o que eu tenho na mão (mistura italiana, alho ou cebola em pó, manjericão, o que for). Eu misturo bem, deixo descansar por um tempo para hidratar as ervas, depois gosto de ter uma ideia aproximada - normalmente acabo adicionando um pouco mais de sal, às vezes mais ervas (dependendo do sabor que eu quero), ajuste a espessura com pasta ou água. Eu sou bastante sensível a proporções exatas, mas isso deve levá-lo a uma distância de gosto e ajuste do seu molho desejado.
Eu não costumo cozinhar o molho por si só, porque para o meu uso ele vai cozinhar no prato - mas se você está fazendo sozinho, em quantidades maiores (digamos, para massas), você provavelmente deve cozinhar para um na parte superior do fogão para deixar as ervas e temperos cozinharem no molho e deixarem os sabores se fundirem.
Se você quiser, pode adicionar outros ingredientes ao molho para obter os sabores que está procurando - alho, cebola, cenoura e aipo, açúcar, azeite de oliva, ervas frescas, tudo o que você quiser. Mas se você está procurando um molho básico de pasta de tomate, água e açúcar ... basta adicionar sal e continuar adicionando até começar a provar como molho.