Sim, você pode absolutamente - essa é a maneira comum de congelar a massa, na verdade. É melhor congelar depois do primeiro aumento. Muitas vezes o segundo aumento será feito na geladeira junto com o descongelamento; e a maioria das receitas que eu vi pular uma terceira subida (assim você congelar a massa em forma, e você está subindo em forma ao lado de descongelar mais um estágio de aquecimento, enquanto você pré-aquecer o forno).
Veja, por exemplo, este guia para congelar massas diferentes ; ou artigo da King Arthur Flour sobre o assunto .