Algumas companhias aéreas têm especificações diferentes. Não posso comentar os exemplos que você deu, mas um exemplo que encontrei está no A340-300.
A companhia aérea para a qual eu trabalhei tinha carregamento convencional de LD3 onde as latas eram carregadas em pares, mas por um tempo tínhamos um A340 alugado da Swiss ou da Sabena (não consigo me lembrar qual, como era há mais de 10 anos) que tinha um posição adicional de LD3 na linha central da aeronave no espaço que normalmente estaria disponível para carregamento a granel.
A coisa que pode afetar o tamanho do compartimento de carga é a localização e o número de banheiros no convés de passageiros. O encanamento geralmente vive debaixo do chão.
Observe que o site da Airbus menciona que as dimensões são aproximadas.