Contação de histórias de má qualidade, na verdade. Eles precisavam de um jeito do Wolverine perder suas memórias, e não pensavam nas conseqüências que isso teria para os filmes anteriores.
Sobre o motivo pelo qual a bala conseguiu penetrar em seu crânio: foi feita de adamantium. A camada de adamantium no crânio de Wolverine não é muito grossa, ou nós a veríamos através de sua pele. Se a bala fosse pontiaguda (AKA: especificamente feita para penetrar em material), ela teria atravessado seu crânio facilmente, já que é o mesmo material.