Você pega um -6, porque sua velocidade é 20, independentemente da ação tomada para mover ou afastar a distância.

Your Jump check is modified by your speed. If your speed is 30 feet then no modifier based on speed applies to the check. If your speed is less than 30 feet, you take a -6 penalty for every 10 feet of speed less than 30 feet. If your speed is greater than 30 feet, you gain a +4 bonus for every 10 feet beyond 30 feet.

Você usa qualquer que seja sua velocidade. Sua velocidade é mais ou menos estática, e não depende de nenhuma ação específica que você esteja realizando. Por exemplo, o seu bônus de Salto não sobe quando você executa a ação Executar, porque sua velocidade ainda é de 20 pés, você apenas move 4 vezes sua velocidade em uma única rodada.

Da mesma forma, a cobrança não aumenta sua velocidade, apenas altera a quantidade de distância que você cobre enquanto ainda consegue fazer um ataque.

(A menos que você tenha um Feat ou algo que diga "Sua velocidade aumenta em 20 pés durante o carregamento", mas nunca ouvi falar de tal coisa)