Eu transportei um computador desktop em um voo internacional no ano passado. Eu não viajei pelos Estados Unidos no entanto (através do Canadá), então eu não tenho certeza sobre o que a TSA pode ou não fazer. Eu acabei envolvendo a bolha e colocando na minha mala que eu chequei. O amortecimento é importante. Contanto que seja acolchoado, deve estar bem.
Assim como uma dica extra, você pode perguntar à pessoa no balcão de check-in para marcar a mala como frágil. Não dependa de manuseio suave. Pack para manuseio descuidado.
Se você acabar retirando os componentes, terá de se certificar de que os envolve em sacos antiestáticos e os manuseie com cuidado durante toda a sua viagem, já que estou assumindo que vai continuar.
EDIT: Pode ser sábio para tirar o disco rígido se você estiver usando um disco rígido em vez de um SSD.