Não, para a maioria das marinadas, não deve haver motivo para que você não as faça antecipadamente e leve à geladeira. Pode até permitir algumas melhorias, uma vez que os sabores de ervas ou especiarias penetram no líquido.
Você só quer praticar boa segurança alimentar, o que significa colocá-lo na geladeira assim que for feito.