Não saberemos a resposta para isso, a menos que / até vermos que isso acontece (novamente) em um filme futuro.
Como você observou, Dias do Futuro Passado alterou a linha do tempo; isso significa que tudo o que vimos acontecer nos três primeiros filmes X-Men , além de X-Men Origins: Wolverine , não é mais necessariamente verdadeiro.
Na linha do tempo original, até onde sabemos, Logan não conhecia ninguém da escola de Xavier até que ele foi resgatado por Cyclops e Storm. Embora haja uma strong implicação de que Xavier conhece Logan, nenhum dos outros X-Men mostra qualquer reconhecimento. No entanto, na nova linha do tempo, já sabemos com certeza que isso não é verdade - ele conheceu vários dos futuros X-Men, além de Mystique e Magneto, nos anos 70, durante Dias de Passado Futuro .
Então, podemos ter certeza de que a introdução de Logan aos X-Men não pode acontecer da mesma forma que em <-em-X-Men - pelo menos algumas dessas pessoas na mansão conhecê-lo. Também é provável que ele, pelo menos, se lembre de Jean Grey.
Para ter certeza, teremos que ver isso acontecer novamente na tela. Sabemos que Hugh Jackman concordou em fazer pelo menos mais um filme dos X-Men, mas o rumor é que ele será baseado em Old Man Logan , uma história que se passa no futuro de Logan, a menos que há flashbacks que provavelmente não ajudam. Nós também não sabemos em que período de tempo a próxima sequela dos X-Men será criada, para saber se Logan irá aparecer no X Mansion durante o filme. Atualmente o plano parece ter pelo menos mais 3 filmes (outra trilogia), o que provavelmente cobriria o prazo certo, e seria muito surpreendente se o Wolverine não estivesse neles, mas é tudo especulação neste momento.