Os programas são projetados para diferentes propósitos, funcionam de maneira diferente internamente e, portanto, têm custos diferentes.
Por exemplo, o SENTRI foi projetado especificamente para uso na fronteira terrestre mexicana, e a maioria das pessoas que possuem um cartão SENTRI são cidadãos americanos ou mexicanos que cruzam essa fronteira com frequência.
Por outro lado, a Global Entry só é realmente útil nos aeroportos, onde ela acelera a entrada permitindo que as pessoas digitalizem seu passaporte em um quiosque, em vez de falar com um policial para verificação de imigração (embora, é claro, todos ainda passem pela alfândega) . Não há tais quiosques nas fronteiras terrestres.
Além disso, para muitas pessoas, a Global Entry foi substituída por outros programas, como o Automated Passport Control (que permite que cidadãos americanos e canadenses e novos viajantes VWP também usem quiosques para controle de imigração) e Mobile Passport Control (que permite Cidadãos dos EUA e do Canadá fazem o controle de imigração de seus smartphones), ambos gratuitos.