É provável que o seu forno, mesmo na configuração mais fria, esteja muito quente. É por isso que a cebola queima e a amargura vem dos pedaços queimados.
Ocasionalmente, uso meu forno elétrico para desidratar frutas e vegetais, mas o meu desce para 50 ° C. Costumo pré-aquecê-lo a cerca de 100 ° C e abaixá-lo quando a comida estiver dentro de alguns minutos, momento em que também abro a porta.
Um forno a gás tem outro problema - queimar gás produz vapor de água, o que dificulta a secagem mesmo com ventilação (você realmente precisa da porta entreaberta para deixar o vapor sair). Secar em um rack (emprestado de uma panela de grelhar ou em um rack de resfriamento de bolo) faz uma enorme diferença.
Eu também tenho um desidratador, mas não é muito melhor do que o forno para um pequeno lote no inverno, então o deixo guardado, exceto quando tenho muito para secar. Ele ganha em capacidade e no fato de eu poder executá-lo fora - vale a pena para pimentões e presumivelmente cebola.