Em última análise, o custo de voar a aeronave foi mais do que a receita que gerou. O Concorde começou um declínio constante para a aposentadoria após o acidente do vôo 4590 da Air France, que matou 113 pessoas, e sofreu um revés após 11 de setembro de 2001. Mesmo com o melhor histórico de segurança na história das companhias aéreas, o acidente combinado com os ataques terroristas para o medo dos passageiros e baixas vendas. As companhias aéreas que operavam o Concorde acabaram perdendo dinheiro na maioria dos vôos e as operações de longo prazo simplesmente não eram sustentáveis. Para piorar a situação, limitou-se a que aeroportos poderia voar nos EUA: JFK, IAD e DFW. A FAA se opôs ao Concorde por preocupações com poluição, ruído e ineficiência de combustível.
A British Airways cita principalmente razões políticas para o fim do seu programa Concorde. Eles alegam que o Concorde teria permanecido lucrativo se a Airbus tivesse retido o avião. No entanto, também houve especulações de que, devido ao número cada vez menor de passageiros, a BA percebeu que poderia ganhar mais dinheiro transportando passageiros de forma subsônica através do Atlântico.