Tudo se resume a como os sistemas individuais funcionam e qual é o objetivo de adicionar mais potência.
Em alguns casos, como no suporte à vida, como mencionado por @jwenting, a energia extra pode ser simplesmente garantir a continuidade da operação do sistema se as fontes secundárias de energia primária e padrão forem interrompidas.
Com armas, o poder extra seria aumentar seu poder destrutivo ou colocá-las em um estado sobrecarregado, como disse @ apoorv020.
Energia extra para blindagens é usada para manter as blindagens quando a capacitância padrão dos geradores de blindagem é reduzida a 0 e para restaurar sua potência total mais rapidamente quando não estão sob fogo.
Com motores, o efeito é semelhante ao das armas, mas com o objetivo de aumentar sua produção para mais velocidade (pense em aumentar o motor do seu carro para a zona vermelha).
Na maioria dos casos, rotear energia adicional para um sistema por longos períodos provavelmente não é uma ação recomendada. Eu também apostaria que, após o episódio, os engenheiros provavelmente farão alguns turnos extras para verificar e reparar qualquer dano causado por pequenas sobrecargas. Mas, em uma pitada de poder adicional para um sistema ou outro pode virar a maré em uma batalha, levá-lo em algum lugar um pouco mais cedo ou aumentar o "aperto" do seu raio trator para mover o asteróide grande.